Laboratoire de génétique moléculaire

Le laboratoire de génétique moléculaire (LGM) fournit des conseils génétiques portant sur la conservation et la gestion des espèces de poissons et de mollusques et crustacés au Canada. La diversité génétique des populations et les rapports génétiques entre les populations sont évalués par le biais de prélèvement d'ADN microsatellite et de variations du complexe majeur d'histocompatibilité (CMH). Les applications incluent la détermination de la structure de population et les unités appropriées d'évaluation et de gestion, l'identification des compositions de stock dans la pêche à stocks mixtes, l’analyse médico-légale, l'évaluation des stocks de géniteurs d’écloserie et d'aquaculture, et la détermination des rapports évolutionnaires chez les poissons téléostéens. Des compositions estimées de stock à partir échantillons de pêche peuvent être mis à la disponibilité des gestionnaires de pêche dans un délai de 9-30 heures après l’arrivée de l'échantillon au laboratoire.

Le LGM est également impliqué dans la recherche sur l'immunité acquise des poissons téléostéens. Pour élucider le rôle que joue la sélection dans le maintien de la diversité au CMH, le laboratoire a compilé (pour le saumon) les plus grandes bases de données de population sur la variation adaptative du CMH disponibles pour une espèce. Des gènes CMH de salmonidés se sont également avérés être associés à la résistance à la N.H.I. Le LGM a récemment commencé un programme de recherche sur l'analyse de l’expression génétique, en utilisant une approche quantitative PCR-CDNA pour évaluer l'expression génétique des gènes uniques ainsi que l'analyse microréseau pour évaluer les changements d'expression génétique de génome entier. Au début, ce travail s'est concentré sur les gènes impliqués dans l'immunité, mais se concentrera à l'avenir sur le profilage d'expression de génome entier des saumons exposés à une variété de perturbations environnementales pour mieux comprendre la réponse physiologique des saumons aux changements de leur environnement.

Équipement principal

• 1 Analyseur d’ADN ABI 3730xl
• 1 Analyseur d’ADN ABI 3730
• 2 Analyseur de séquence d'ADN ABI 377
• 1 Système RCP ABI 7900HT à haute vitesse en temps réel
• 1 Robot Beckman Biomek FX équipé d’une tête à canaux multiples et d’un carrousel intégré
• 1 Robot Beckman Biomek NXP équipé d’une tête à 8 canaux et un Lecteur de plaque intégrée DTX 880
• 1 Robot Beckman Biomek NX équipé d’une tête à canaux multiples
• 1 Lecteur de plaque autonome Beckman DTX 880
• 3 Machines ADN Bio-Rad Tetrad2 équipées d’unités alpha avec 96 puits
• 4 Machines ADN Bio-Rad Tetrad2 équipées d’unités alpha avec 384 puits
• 16 Systèmes universels Bio-Rad Dcode pour la détection des mutations
• 2 Systèmes d'imagerie par fluorescence Hitachi FMBIO 2
• 1 Machine de recherche ADN MJ Opticon
• 20 Machines de recherche PCR MJ PTC 100
• 1 Analyseur microréseau Packard BioScience ScanArray Express
• 1 Station d’hybridation TECAN HS 4800 Pro équipée de deux appareils supplémentaires