Laboratoire de génétique moléculaire - Projets réalisés

• La génomique et le mystère du saumon rouge du fleuve Fraser
• Probiotiques
• Mise au point et mise en application de techniques de biologie moléculaire pour valider et améliorer l’évaluation du régime alimentaire des pinnipèdes
• Conservation, structure de population et identification des stocks
• Analyse généalogique
• Analyse médico-légale
• Complexe majeur d’histocompatibilité
• Analyse par microréseaux d’ADN/RT-PCR quantitative

Conservation, structure de population et identification des stocks

Saumon du Pacifique

• Saumon rouge
  • 14 loci microsatellites et 2 loci du CMH étudiés chez 45 000 saumons rouges provenant de 270 populations distribuées au Japon, en Russie, en Alaska, en Colombie-Britannique et dans l’État de Washington
  • Estimation de la composition des stocks chez 20 000 saumons rouges provenant de pêches mixtes effectuées dans le sud-est de l’Alaska et en Colombie-Britannique
  • En cours de saison, la composition des stocks de saumon rouge est remise à l’intérieur d’une période de 30 heures pour permettre une gestion plus opportune des stocks de saumon rouge en péril
• Saumon coho
  • 13 loci microsatellites et 2 loci du CMH étudiés chez 45 000 saumons coho provenant de 260 populations distribuées en Alaska, en Colombie-Britannique, dans l’État de Washington, en Orégon et en Californie
  • Estimation de la composition des stocks chez 30 000 saumons coho provenant de pêches mixtes effectuées dans le sud-est de l’Alaska, en Colombie-Britannique et dans l’État de Washington
• Saumon quinnat
  • 13 loci microsatellites étudiés chez 45 000 saumons quinnat provenant de 270 populations distribuées en Russie, en Alaska, dans le territoire du Yukon, en Colombie-Britannique, dans l’État de Washington, en Orégon et en Californie
  • Estimation de la composition des stocks chez 20 000 saumons quinnat provenant de pêches mixtes effectuées en Colombie-Britannique
• Saumon kéta
  • 13 loci microsatellites étudiés chez 8 500 saumons kéta provenant de 70 populations en Colombie-Britannique, dans le sud-est de l’Alaska, dans le fleuve Yukon et au Japon
  • Estimation de la composition des stocks chez 300 saumons kéta provenant de pêches mixtes effectuées en Colombie-Britannique
• Truite arc-en-ciel
  • 19 loci microsatellites étudiés chez 3 200 truites arc-en-ciel provenant de 40 populations en Colombie-Britannique et dans l’État de Washington
  • Estimation de la composition des stocks chez 2 100 truites arc-en-ciel provenant de pêches mixtes effectuées en Colombie-Britannique
• Saumon atlantique
  • 9 loci microsatellites et 3 loci du CMH étudiés chez 2 000 saumons atlantiques provenant de 3 sites sur la rivière Conne à Terre-Neuve et de fermes d’élevage en Colombie-Britannique
• Saumon kokanee
  • 14 loci microsatellites et 2 loci du CMH étudiés chez 600 saumons kokanee provenant de 7 sites en Colombie-Britannique

Poissons marins

• Morue
  • 7 loci microsatellites, 1 locus FTFR (RFLP) et 1 locus du CMH étudiés chez 5 300 morues provenant de 19 sites adjacents à Terre-Neuve
  • Estimation de la composition des stocks chez 400 morues juvéniles provenant de sites côtiers à Terre-Neuve
  • Résolution de la structure de population chez les morues des eaux adjacentes à Terre-Neuve
• Hareng du Pacifique
  • 15 loci microsatellites étudiés chez 23 000 harengs provenant de 95 sites en Alaska, en Colombie-Britannique, dans l’État de Washington et en Californie
  • Estimation de la composition des stocks chez 2 000 harengs juvéniles provenant du détroit de Johnstone en Colombie-Britannique
  • Résolution de la structure de population chez les harengs en Colombie-Britannique
• Sébaste du Pacifique
  • 5 loci microsatellites étudiés chez 1 300 sébastes du Pacifique provenant de 14 sites en Colombie-Britannique
  • Résolution de la structure de population chez le sébaste du Pacifique en Colombie-Britannique
• Sébaste aux yeux jaunes
  • 13 loci microsatellites étudiés chez 3 200 sébastes aux yeux jaunes provenant de 30 sites en Colombie-Britannique
  • Résolution de la structure de population chez le sébaste aux yeux jaunes en Colombie-Britannique
• Sébaste à queue jaune
  • 20 loci microsatellites étudiés chez 500 sébastes à queue jaune provenant de 5 sites en Colombie-Britannique
• Sébaste à dos épineux
  • 18 loci microsatellites étudiés chez 1 000 sébastes à dos épineux provenant de 16 sites en Colombie-Britannique
• Poisson-chandelle
  • 14 loci microsatellites étudiés chez 2 000 poissons-chandelle provenant de 9 sites en Colombie-Britannique et dans l’État de Washington
  • Estimation de la composition des stocks chez 500 poissons-chandelle provenant de pêches mixtes en Colombie-Britannique
• Morue-lingue
  • 10 loci microsatellites étudiés chez 500 morues lingues provenant de 5 sites en Colombie-Britannique

Invertébrés

• Ormeau
  • 12 loci microsatellites étudiés chez 3 000 ormeaux provenant de 22 sites en Colombie-Britannique
• Panope
  • 6 loci microsatellites étudiés chez 1 200 panopes provenant de 15 sites en Colombie-Britannique et dans l’État de Washington
• Oursin rouge géant
  • 13 loci microsatellites étudiés chez 600 oursins rouges géants provenant de 4 sites en Colombie-Britannique et de 2 sites en Alaska
• Crabe de Dungeness
  • 9 loci microsatellites étudiés chez 400 crabes de Dungeness provenant de 6 sites en Colombie-Britannique

Analyse généalogique

• Évaluation des stocks et analyse généalogique réalisées chez des stocks géniteurs de saumons quinnat, coho et atlantiques provenant d’installations de pisciculture situées en Colombie-Britannique et à Terre-Neuve.

Analyse médico-légale

• Preuve présentée sur l’identification des espèces et des stocks de saumon du Pacifique qui s’est révélée un facteur clé pour l’obtention de plaidoyers ou déclarations de culpabilité dans le cadre de 25 causes judiciaires.
• Développement d’une espèce d’ormeau pour l’espèce en péril Haliotis kamtschatkana.
• Développement d’une espèce de poisson marin pour les poissons marins

Complexe majeur d’histocompatibilité

• Examen des corrélations entre le génotype CMH et la résistance à la maladie chez les saumons quinnat, coho et atlantiques
• Relevés des populations de saumons rouges, kokanee et coho ainsi que de morues
• Étude des relations évolutionnaires entre les poissons téléostéens

Analyse par microréseaux d’ADN/RT-PCR quantitative

• Évaluation de la réponse physiologique du saumon face aux perturbations environnementales (i.e. pollution, température, maladie) grâce à l’étude du profil d’expression génétique
• Étude en simultané de la régulation de 4 à 16 mille gènes